館藏清點主要有以下幾個步驟：①準備階段。明確清點的原則、范圍、方法、時間、參加人員等，催還逾期書刊，整理排架順序、排架目錄、借閱記錄等。②清點階段。③核對階段。主要按架排目錄、文獻財產登記簿、檢查卡等進行核對，一般先編號，再打亂重新排列，然后還原。④總結階段。
館藏清點的方法主要有：①排架目錄清點法。排架目錄是反映藏書在書架上順序的一種目錄。用排架目錄 清點藏書的具體做法是：清點時，先用目錄卡片核對書架上的文獻和核對已借出文獻的出借記錄，將每件文獻的題名、著者、索書號和登記號等逐一核對，然后再用目錄卡與個別財產登記簿進行核對，查清實存藏書數量，注銷遺失損毀文獻，做到文獻、卡、帳完全一致。這種方法的優點是：快速、準確，可以分組、分類同時進行，比較方便，通過清點，可以恢復正確的排列次序，改正亂架現象。②個別登記簿清點法。這種方法是利用文獻財產登記簿直接核對架上每一文獻，然后再用登記簿核對分類目錄，達到文獻、卡、帳統一。它適用于按個別 登記號順序排架的文獻，是局部藏書清點所采用的方法。
③檢查卡清點法。這種方法是在清點工作之前，對所清點的每份文獻都要制一張檢查卡，卡上填寫每一份文獻的題名、著者、索書號和登記號等，按登記號順序排列，然后將檢查卡與財產登記簿核對，達到文獻、卡、帳一致。這種方法比較準確，但費時，適用于沒有書袋卡和沒有排架目錄的小型圖書館。
清點之后需要對清點工作進行總結。主要包括 4個方面：統計清點過的各類文獻數字；對確定丟失或損壞無法使用的文獻填寫注銷單，經主管批準后辦理注銷手 續；對一時不知下落的文獻和其他遺留問題，要指定專人負責繼續清理；撰寫清點工作總結報告，提出加強藏書保護和改進管理工作的意見。