2020年，南通市生態環境質量達“十三五”以來最好水平，全市污染防治攻堅戰成效明顯，受到省政府通報表彰。“十四五”期間，南通市將繼續圍繞持續改善環境質量和深入打好污染防治攻堅戰，堅持方向不變、力度不減、標準不降，突出精準治污、科學治污、依法治污；加快推進生態環境治理體系和治理能力現代化，力爭發揮南通區位優勢和生態特色，為“江蘇試點”貢獻更多“南通經驗”。
近年來，南通堅持把保護和修復長江生態環境擺在壓倒性位置，確立“地處長江下游、工作勇爭上游”的目標定位，以環境質量改善為核心，打造沿江生態修復示范段，推動長江經濟帶高質量發展。隨著《南通市長江經濟帶生態環境保護實施規劃》等文件出臺，南通市開展長江保護修復駐點研究，完成國家生態保護紅線優化調整，加強生態環境空間管控，推進化工產業整治提升。整體關停沿江污染嚴重、工藝落后、影響水源地保護的工業企業、港口碼頭，長江岸線生產、生活、生態空間布局比例由48:3.5:48.5調整為39:10:51。實施沿江大規模增綠，建成南通首個國家級森林公園。完成長江入河排污口排查，啟動監測溯源分析。完成4371家“散亂污”企業分類整治，建立長效管理機制。對八大類1367個突出環境問題加強整改，整改完成率超99%。
2020年南通市共收獲321個藍天，空氣質量優良率達87.7%、連續三年排在全省第一；PM2.5平均濃度34微克/立方米，省內首批達到國家空氣質量二級標準。水環境質量方面，省考以上斷面達到或優于Ⅲ類比例達90.3%、改善幅度全省第一；主要入江入海河流平均水質消除劣V類。縣級以上集中式飲用水水源地達標率保持100%。土壤環境質量方面，完成土壤污染狀況詳查，基本摸清底數，初步建立污染地塊優先管控名錄。受污染耕地、污染地塊安全利用率均達90%以上。