雍正元年，憲皇帝即位。詔曰：“臺灣自古不屬中國，我皇考神武遠屆，拓入版圖。末年逆賊朱一貴倡亂攻陷全臺，諸臣夙稟方略，士卒感戴教養之恩，七日克服，破賊數萬。當皇考春秋高邁，威播海外，所有立功將士，其各加等議敘。”
嗚呼！感矣哉！師武臣力，如圣祖之世，而猶有此患。
考康熙六十年夏四月，臺灣朱一貴之叛，激于知府王珍稅斂苛虐、濫捕結會及私伐山木之民二百余，淫刑以逞。鳳山奸民黃殿、李勇、吳外等因民弗忿，又窺臺吏文婪武嬉，遂謀變也。以一貴朱姓，可托明裔。而一貴販鴨，旦暮出入，自成行列；煽烏合數百，夜劫岡山塘汛，揭竿荷耰無器械。
岡山距府城三十里，疾趨掩之，立可撲滅也。總兵歐陽凱聞警，集眾議。游擊劉得紫最知兵，請行，不許；而遣游擊周應龍以兵四百及四社土番數百往。
應龍者，龐軀有口，實無能。行五里，即止營；次日，再進十五里。賊刦槺榔林汛，戕把總、掠軍器，應龍隔一溪不救。賊旁掠四出，于是南路奸民杜君英等，亦蠢起應之。周應龍遇賊岡山，一交綏，賊即敗走入山，應龍又不追，而縱兵番焚掠近村。于是各鄉皆煽于賊，樹幟響應。
南路賊攻參將苗景龍于淡水營，周應龍聞報，復行十五里；翼日遇賊赤山，方合戰，應龍遽以后隊遁歸府城。一貴大隊隨之，而君英等賊別攻鳳山，參將苗景龍敗死，府城大震；文武各吏盡室登舟，人無固志。
總兵歐陽凱、游擊劉得紫、副將許云，率師千有五百出御之。中夜自驚擾，黎明稍集，而賊至。許云躍馬陷陣，官兵繼之，賊大敗，退屯竿津林。時水師游擊游崇功出哨笨港，聞報，亦以兵還入鹿耳門赴援。
五月朔，朱一貴、杜君英合隊數萬來犯，劉得紫以兵截中路口，歐陽凱、許云、游崇功迎戰春牛埔。而把總楊泰通賊為內應，刺歐陽凱墜馬死，官兵大潰。劉得紫率兵還救，馬踣被執，許云、游崇功血戰至日中，矢炮俱盡，各手刃數十賊以死。于是水師游擊張賢、王鼎等率兵千余、戰艦四十揚帆出澎湖，臺廈道梁文煊、知府王珍等盡驅港內商、漁艇出鹿耳門渡海；而周應龍遁回內地。
是日，賊陷臺灣，掠倉庫；復開紅毛樓，大獲鄭氏舊貯炮械、硝磺、鉛鐵。北路奸民賴池、張岳等亦同日陷諸羅，戕參將羅萬倉。凡七日，而全臺陷。
朱一貴偽稱中興王，號永和，大封群賊。公、侯、太師、將軍、總兵以千計，優伶冠服肩摩塞道；民為之謠曰：“頭冠明朝冠，身衣清朝衣；五月稱永和，六月還康熙”；蓋人心皆不附賊也。
游擊劉得紫陷賊中，賊素重其名不殺，聽收■〈疒〈癶上土下〉〉各帥之尸；禁諸學宮，七日不食。諸生林皋、劉化鯉密陳諸賊可滅狀，始受食，謀恢復。
時逃官、難民皆至澎湖，澎湖協副將倉皇不知所措，亦盡室登舟，將渡廈門。百姓婦女爭舟雜沓，聲震海岸。守備林亮厲聲曰：“朝廷以海外封疆付諸臣，正備緩急倚賴；今未見一賊，相率委去，若國事何？與其死國法，曷若死賊。請整兵船守要害，俟賊至決戰；不勝我死，公等走未晚也。”
馳赴海濱，拔刀驅官民家屬登岸，眾心始固。
時水師提督施世驃在廈聞警，即調兵渡海；總督覺羅滿保疾馳至廈門，施世驃已先二日率師出港矣。滿保復調南澳鎮總兵藍廷珍至廈，使總統渡臺水陸兵八千余、船四百艘。六月朔，出廈門港；七日，會提督施世驃于澎湖，共兵萬二千有奇、大小舟六百余艘。
方是時，臺中賊黨互相雄長攻擊；杜君英為朱一貴敗走，剽掠村莊。而淡水營守備陳策團練義勇，固守要害；又率淡水莊義民侯觀德、李直三等以鄉兵破朱一貴賊數萬，斬賊萬計。而諸羅義民陳徽等亦起兵攻復縣治；旋為賊陷。
陳策遣人赴澎、廈請兵，滿保、施世驃先后發兵千七百赴援。適世驃獲賊諜吳良等二人于澎湖，搜獲偽扎百道。吳良，澎湖把總降賊者也；窮訊之，盡知賊黨內亂，百姓不附，我軍士氣倍奮。滿保議三路進攻。廷珍與世驃言“南風已盛，南路不可泊舟；北路去府百余里，餉運艱難，度賊必屯聚中路，宜直搗鹿耳門。”
十日發澎湖，以守備林亮、千總董方為前鋒，并率善水者十余駕小舟于鹿耳門表識沙路，并載旗幟伏南北港。時賊以大炮扼險迎拒；十三日，林亮、董方以六舟冒死直進，遙望炮臺火藥累積，專以炮注攻中之，轟發如雷，賊死無算。眾軍齊集兩港，悉樹我軍旗幟；遂揚帆直渡鯤身。鯤身者，海沙也，膠淺不能行大舟；是日海潮驟漲八尺，四百余船倏齊薄岸。賊遁保安平鎮，列隊迎拒；林亮、董方復先登陷陣，藍廷珍督大隊繼之，賊敗走。官兵入安平鎮，日猶未晡。
是夕，施世驃亦乘潮至鹿耳門，次日至鎮。賊以八千來犯安平，我兵迎賊于四鯤身；別遣小舟沿岸夾擊，逐北至七鯤身瀨口，復以火舟燒賊戰艦。十六日，賊數萬復犯安平，駕牛車列盾為陣，冒炮火死突。藍廷珍親督戰于二鯤身，而林亮等別以小舟載炮附岸夾攻，斬溺無算。賊始退保府治，不敢出；惟沿岸列炮，晝夜固守。施世驃等下令戒各軍無妄殺，來降者悉縱還，各樹“大清良民”幟于門；惟抗拒者誅。遠近脅從，望風解散。
有西港仔義首載家屬為質，愿引大兵從西港登岸，徑收賊巢；施世驃即密遣林亮、董方等，以兵千有二百往。十八日，藍廷珍聞之，急曰世驃曰：“此險道也，地多篁木，易設伏。且迫賊肘腋，丑黨必眾，而我軍甚孤；若伏賊數千環攻乘我，將奈何？”
世驃曰：“可奈何？”
廷珍曰：“請急以大隊進，而別遣將分攻各港牽制，使不得兼顧。”
于是廷珍率舟師五千五百，夜指西港仔，黎明登岸；則賊與林亮等方鏖戰，我軍嚴陣設伏而進，前鋒遇賊力戰，伏兵突出竹林，橫截賊軍，左右奇兵繞后夾攻，賊大潰北。廷珍料賊必夜來劫營，初更卷帳偃旗伏蔗林間；賊果至，不見一人，大驚，伏起沖擊，大敗之。
十九日，逐北至府城，賊數萬皆遁。而施世驃亦分敗西、南兩路之賊，同日抵城。自鹿耳門至是，凡七日。廷珍報滿保于廈門，而施世驃先于軍中奏捷矣。
復分遣官兵廓清南、北二路。而游擊劉得紫亦于賊中拔歸大營，請為鄉導；淡水營守備陳策率援淡之兵南下諸羅，與大軍合，北路賊黨潰散殆盡。
朱一貴走灣里溪，為村民禽獻；惟逆黨杜君英、杜會三、陳福壽、江國論等尚未獲。廷珍購得一二，皆善待之；使轉招其黨。旬日，先后出降；與朱一貴皆檻送京師，磔死。臺灣平。其敗逃之游擊周應龍及棄臺逃回之道、府、廳、縣訊治伏法，知府王珍剖棺梟示。先是，朝廷得施世驃捷奏，大喜；賜東珠朝帽、黃帶四團龍補服。又徑擢淡水營守備陳策為臺灣鎮總兵官，加左都督；藍廷珍仍統兵留臺灣彈壓：以施世驃奏中不及廷珍戰功也。
八月，臺灣怪風暴雨，流火燭天；竟夜海水皆立，諸港船互相撞壞如漂柹敗葉，或飄上平陸；地大震。翼日始霽，郡無完宅，壓、溺死者數千。以風災奏聞，發帑開倉大賑。而施世驃終夜露立風雨中，驚悸疾作，以九月望日卒于軍；調廣東提督姚堂代其任。
時廷議移臺鎮總兵官于澎湖，而設陸地副將于府治，裁水、陸兩中營歸內地。藍廷珍力爭不可，提臣姚堂亦以為言。乃仍令總兵鎮臺，副將駐澎；特命滿、漢御史各一員，歲巡臺灣，察民疾苦。
廷珍之征臺也，其弟鼎元在軍中；文移書檄，皆出其手。如論臺鎮不可移澎；又言臺變皆自內起，罕自外入，鹿耳門不宜設炮城以資賊守，而阻攻討；又言諸羅以北地險軍單，難以控制，宜割為二縣；皆不易之論。其后乾隆中用其言，分立彰化縣云。
鼎元號鹿洲，漳浦人，由貢生官至廣州知府。有“平臺紀略”、“鹿洲文集”，說海防甚具。或問朱一貴以前，紅毛取倭、鄭氏取紅毛、本朝取鄭氏，非皆變自外入者乎？臣源曰：耶蘇不惑、紅毛不乘、夷間不投、鄭兵不興、子不少、國不內亂，王師亦豈得而馮陵乎？日月蝕于外，其賊在于內！